核酸定量依賴于測量DNA和RNA的紫外吸收率,常見于260納米,核堿基在該處吸收力強(qiáng)。通過結(jié)合比爾-朗伯定律與消光系數(shù),吸收值可以直接與核酸濃度相關(guān)。230 nm和260 nm的吸收為評估樣品純度提供了便捷的基礎(chǔ),支持基因組DNA、PCR產(chǎn)物及其他制備核酸樣品的質(zhì)量控制。與熒光染料測定結(jié)合使用,吸收度測量為定義DNA或RNA濃度提供了實(shí)用框架,以便后續(xù)應(yīng)用。
比爾定律是描述物質(zhì)濃度與其在已知光程距離下光吸收之間的關(guān)系的方程。
我們可以用核酸濃度因子替代消光系數(shù),因?yàn)檫@是另一種可用來關(guān)聯(lián)物質(zhì)吸收光線能力與濃度的數(shù)值。隨后可用于核酸定量。
什么是核酸濃度因子,它們是如何確定的?
核酸濃度因子是波長特異性的轉(zhuǎn)換因子,將吸收率與不同核酸類型的濃度聯(lián)系起來,從而能夠通過紫外吸收率測量直接計(jì)算DNA或RNA濃度。
這些核酸濃度因子是通過測量特定核酸在特定路徑長度下吸收為1所需的濃度來確定的。已確定,在1厘米路徑長度下,吸收率為1(1 Abs)需要0.02 ng/μL的dsDNA濃度。
該濃度隨后可利用下方重組的比爾定律方程求得因子(F)值。該因子隨后將替換消光系數(shù):
該因子可用于下方重新排列的比爾定律方程,求解吸收度測量的未知濃度,如DS-11系列分光光度計(jì)所示:
同樣的計(jì)算方法也用于確定其他核酸的濃度因子。DS-11還用到的其他因素如下:
ssDNA:33 ng/uL
ssRNA:40 ng/uL
這些濃度因子與其消光系數(shù)成反比。在260納米處,1A所需的核酸量越高,相應(yīng)的濃度因子越低。
為什么核酸濃度因子不同?
dsDNA、ssDNA和RNA具有不同的化學(xué)和結(jié)構(gòu)性質(zhì),導(dǎo)致光吸收行為各異。這意味著每種核酸的濃度不同,才能在260納米波長下達(dá)到1.0的吸收率。核酸的以下特性導(dǎo)致了消光系數(shù)和濃度因子的不同:
dsDNA:其雙螺旋結(jié)構(gòu),鍵彼此接近,氫鍵將結(jié)構(gòu)連接在一起,導(dǎo)致紫外線吸收率降低。
ssDNA:其堿基暴露得更明顯,不像DSD那樣受到堿基堆疊的相互作用影響。
RNA:核糖和額外的羥基會(huì)干擾紫外線吸收。
學(xué)習(xí)如何用DeNovix計(jì)算核酸濃度
核酸濃度因子為利用吸收度計(jì)算核酸濃度提供了一種簡化的方法。這些變化的數(shù)值恰當(dāng)?shù)乜紤]了核酸結(jié)構(gòu)差異導(dǎo)致的光吸收模式差異。您可以通過這里的微體積核酸性能數(shù)據(jù),了解DS-11系列分光光度計(jì)/熒光儀在寬廣范圍內(nèi)實(shí)現(xiàn)的高精度和線性度。或者聯(lián)系咨詢!